• Catherine ANDRÉ (CR1) [Contact] [Publis]
• Francis GALIBERT (PUHC) [Contact] [Publis]
• Pascale QUIGNON (MCU) [Contact] [Publis]



• Anne-sophie GUILLORY (CDD Vétérinaire) [Contact] [Publis]
• Christophe HITTE (IR1) [Contact] [Publis]
• Laëtitia LAGOUTTE (CDD) [Contact] [Publis]
• Naoual SADEQUI (CDD) [Contact] [Publis]



• Naïma BENBERNOU (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Édouard CADIEU (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Thomas DERRIEN (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Marc GILLARD (Doctorant) [Contact] [Publis]
• Anaïs GRALL (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Richard GUYON (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Benoît HÉDAN (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Estèle LAFONT (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Michaëlle RAKOTOMANGA (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Stéphanie ROBIN (Post-doc) [Contact] [Publis]
• Amaury VAYSSE (Doctorant) [Contact] [Publis]

I. Le modèle canin pour l'étude des maladies génétiques

L’espèce canine comprend plus de 400 races correspondant chacune à un isolat génétique. Le chien constitue ainsi un modèle puissant pour identifier les gènes responsables de nombreuses maladies génétiques. Les races canines actuelles sont affectées par des maladies génétiques spontanées, spécifiques de races et très fréquentes. Notre équipe recherche les bases génétiques de maladies homologues entre le chien et l’homme, dans le but d’identifier les gènes directement responsables ou les gènes de prédisposition. À terme, les objectifs sont d’identifier de nouveaux marqueurs pronostiques et de nouvelles cibles thérapeutiques dans les maladies liés aux cancers (sarcomes, mélanomes, ostéosarcomes, gliomes…), aux désordres neuro-sensoriels (épilepsies, rétinites pigmentaires), aux génodermatoses (ichtyoses et kératodermie)…

II. Étude fonctionnelle de l'olfaction

L’olfaction est l’un des sens qui permet à tous les animaux terrestres ou marins  d’appréhender le milieu extérieur dans leur quête de nourriture, la recherche de partenaires pour assurer leurs descendances ou fuir les prédateurs et autres dangers. Le but de nos recherches est de comprendre les fondements génétiques des capacités olfactives exceptionnelles des chiens, dont plusieurs races ont été sélectionnées sur des critères de performance olfactive.

III. Étude de la diversité génétique et de l’évolution des génomes

Depuis la domestication du loup, la sélection et la création des races canines a abouti à une extrême variabilité chez le chien. L’objectif de nos travaux est de rechercher les signatures génétiques liées à la domestication du chien, de caractériser les gènes canins sélectionnés au cours de l'évolution pour leur caractère avantageux (sélection positive) et de développer des méthodes informatiques et statistiques pour les analyses génétiques dédiés au modèle canin.

Les compétences développées au cours de l’analyse de la structure du génome canin continuent d’être exploitées dans le cadre de plusieurs projets européens ou nationaux d’analyse de la structure des génomes chez les poissons et d’autres espèces marines (dorade, bar, tilapia, truite, huitre)

Légendes :
Figure 1 : Loups il y a 15 000 ans, devenus chiens de races au polymorphisme inégalé (Léonberg et Shi-tzu), mais conformes au standard de chaque race, le chien, avec autant d’isolats génétiques que de races représente un modèle unique ou ségrègent des maladies génétiques spontanés monogéniques ou complexes,  spécifiques de races canines et homologues aux maladies humaines correspondantes.
Figure 2 : Développement d’outils statistiques et bio-informatiques d’analyses génétiques. Le serveur web AUTOGRAPH (http://autograph.genouest.org)développé au laboratoire, permet de comparer la structure des génomes entre espèces, d’identifier les conservations et les ruptures de synténie entre chromosomes au cours de l’évolution et de repérer sur plusieurs génomes les locus d’intérêt, avec leur environnement génique respectifs.
Figure 3 : De la recherche de truffes dans le Périgord (Lagotto romagnolo) à la recherche génétique sur l’olfaction. Les mécanismes moléculaires des performances olfactives sont analysés en mettant à profit la variabilité des compétences olfactives des diverses races de chien.

Publications

Cadieu E, Neff M, Quignon P, Walsh K, Chase K, Parker HG, Vonholdt BM, Rhue A, Boyko A, Byers A, Wong A, Mosher DS, Elkahloun AG, Spady TC, André C, Lark KG, Cargill M, Bustamante CD, Wayne RK, Ostrander EA. Coat Variation in the Domestic Dog Is Governed by Variants in Three Genes. Science, 2009, 326(5949):150-3.

Robin S, Tacher S, Rimbault M, Vaysse A, Dreano S, Andre C, Hitte C, Galibert F. Genetic diversity of canine olfactory receptors. BMC Genomics, 2009, 10(1):21.

Hitte C, Madeoy J, Kirkness EF, Priat C, Lorentzen TD, Senger F, Thomas D, Derrien T, Ramirez C, Scott C, Evanno G, Pullar B, Cadieu E, Oza V, Lourgant K, Jaffe DB, Tacher S, Dreano S, Berkova N, Andre C, Deloukas P, Fraser C, Lindblad-Toh K, Ostrander EA, Galibert F. Facilitating genome navigation: survey sequencing and dense radiation-hybrid gene mapping. Nat. Rev. Genet., 2005, 6(8):643-8.

Plus d'information sur le site : The Canine Radiation Hybrid Mapping Project